據監察院調查，104年度中央政府總決算列有政府捐助之財團法人總計有158個，部分財團法人獲得政府長期補助，另外，電信協會、郵政協會、武智基金會（糖協）等，在二戰結束後，接收日本政府遺留財產，官派董監事席次未過半，法人治理機制未臻完備，屢遭輿論批評；社團法人部分，最近除奧委會認定全國性單項體育協會遭外界質疑財務不透明外，婦聯會、救國團在政黨輪替後，被認定為國民黨附隨組織，文化總會則發生理監事改選爭議，政府無法取回主導權情事。 根據監察院調查，104年度中央政府總決算，列有政府捐助之財團法人總計158個，基金總額2579.28億元，其中政府捐助基金2073.99億元，占80.41％，當年度另接受政府補助及委辦經費494.42億元，在政府財政結構持續弱化之際，政府對財團法人之資金挹注卻未減反增，公共資源配置之經濟性迭受質疑
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